1、 首先对于食品微生物污染要采取一定的预防措施，许多食品，例如水果，蔬菜，鱼肉禽蛋类等，内部虽然不含有微生物，但是外部往往会带有各种各样的微生物，并且在某些条件下，数量相当巨大，这些微生物的存在，会在适当的条件下进行繁殖，这样可以危害大家的身体健康。

2、 另外要减少和去除食品中已有的微生物，这样做的操作方法有很多种，例如可以通过过滤，也可以通过离心，沉淀，加热灭菌干燥，辐射等等，可以根据这些食品的不同性质，选择实用的操作方法，这样就可以减少和去除食品中已有的微生物。

3、 最后可以控制食品中残留微生物的生长繁殖，特别是在加工处理食品的时候，可能会残留一些微生物，做好控制的方法，有低温法，干燥法，已经有防腐剂发等等，这样可以控制微生物的生长。